时间：2023年5月4日（周四）下午16:00-17:30

Time：16:00-17:30, Thursday, May 4^th, 2023

主持人: 西湖大学理学院PI 窦文杰博士

Host: Dr. Wenjie Dou, PI of School of Science, Westlake University

地址：西湖大学云谷校区E10-405

Venue: E10-405，Yunqgu Campus, Westlake University

张增辉讲席教授

深圳理工大学（筹）合成生物学院

主讲人/Speaker：

张增辉1982年毕业于华东师范大学物理系，同年作为CUSPEA学生赴美留学，于1987年毕业于美国休斯顿大学物理系，获化学物理博士学位，随后在加州大学伯克利分校化学系从事博士后，任纽约大学化学系助理教授，副教授，教授，南京大学学科特区理论与计算化学研究所首任所长，华东师范大学教授，上海纽约大学-华东师范大学计算化学联合研究中心主任，现任中科院深圳理工大学（筹）合成生物学院讲习教授。获美国Camille and Henry Dreyfus New Faculty Award（德瑞福斯青年教授奖），Sloan Research Fellow（斯隆研究奖），Camille Dreyfus Teacher-Scholar（德瑞福斯教师－学者奖），以及美国基金委颁发的“总统教授奖”(Presidential Faculty Fellow)，是中国科学院首批海外评审专家，国家基金委海外杰出青年学者 (B类)，上海市浦江学者，第六届中国侨界贡献奖，英国皇家化学会Fellow。在国际核心学术刊物上发表论文430余篇，论文他人引用14,000余次，H-index指数64 （web of science）。目前担任Phys. Chem. Chem. Phys.副主编以及多个国际国内期刊的编委。现担任深圳理工大学（筹）合成生物学院讲席教授。

讲座摘要/Abstract:

随着计算机计算和人工智能技术的高速发展，怎样发展基于第一性原理的理论计算方法来充分应用计算机的计算优势，来直接计算模拟实际的化学反应体系以及生物分子的相互作用过程，实现in silico的复杂分子体系模拟。通过计算模拟实际化学反应过程，我们可以获得及其详细的化学过程的微观机制，发现新的反应路径，甚至发现新的分子。这里我们介绍针对高能分子热裂解过程，燃烧反应过程以及有机反应体系的模拟方法以及对模拟结果的分析结果。对于生物体系，报告介绍蛋白-蛋白结合自由能及蛋白变异对结合自由能的定量影响的计算方法的一些研究工作。这些方法的应用为我们研究，认识和设计蛋白-配体及蛋白-蛋白相互作用提供了原子层面的有用信息，为进一步发展更精确可靠的理论计算新方法提供有用的参考价值。

With the rapid development of computer and artificial intelligence, how to develop computational methods based on first principles to make full use of the computing powers of computers, to directly simulate realistic chemical reaction systems and the interaction processes of biomolecules in silico becomes a new challenge. By simulating realistic chemical reaction process, we can extract the detailed dynamics information to help us understand the microscopic mechanism of the chemical process, discover new reaction pathways, and even discover new molecules. Here we describe our simulation studies for the pyrolysis of high-energy molecules, the combustion of methane and an organic reaction system. The analysis of trajectories of these reactions provide detailed information about important reaction processes and new insight on the reaction mechanism. For biological systems, we report some recent work in the computational study of protein-protein binding free energy and the quantitative effect of protein variation on binding free energy. The application of these methods provides useful information at the atomic level for us to understand and design protein-ligand and protein-protein interactions, and provide helpful guidance for further development of more accurate and reliable new theoretical calculation methods.

讲座联系人/Contact:

理学院，陈艳艳，邮箱：chenyanyan@westlake.edu.cn

School of Science, Yanyan Chen, Email: chenyanyan@westlake.edu.cn